Формат данных для логического вывода

Сначала ознакомьтесь с документацией по общему формату данных (dataset_format.md)!

Формат данных для логического вывода должен соответствовать формату, используемому для необработанных данных (в частности, изображения должны быть в том же формате, что и в папке imagesTr). Как и прежде, имена файлов должны начинаться с уникального идентификатора, за которым следует 4-значный идентификатор модальности. Вот пример для двух разных наборов данных:

1. Task005_Prostate:

   Эта задача имеет 2 модальности, поэтому файлы во входной папке должны выглядеть следующим образом:

    input_folder
    ├── prostate_03_0000.nii.gz
    ├── prostate_03_0001.nii.gz
    ├── prostate_05_0000.nii.gz
    ├── prostate_05_0001.nii.gz
    ├── prostate_08_0000.nii.gz
    ├── prostate_08_0001.nii.gz
    └── ...

   _0000 должно быть изображением T2, а _0001 — изображением ADC (как указано в «channel_names» в dataset.json), точно так же, как это использовалось для обучения.

2. Task002_Heart:

    imagesTs
    ├── la_001_0000.nii.gz
    ├── la_002_0000.nii.gz
    ├── la_006_0000.nii.gz
    └── ...

Сегментации в выходной папке будут называться {CASE_IDENTIFIER}.nii.gz (без учёта идентификатора модальности).

Помните, что формат файла, используемый для логического вывода (.nii.gz в этом примере), должен быть таким же, как и тот, который использовался для обучения (и как было указано в 'file_ending' в dataset.json)!