После тестирования выяснилось, что Eclipse Version: 2018-12 (4.10.0) позволяет использовать JPA для создания метамодели. Однако в Eclipse Version: 2020-09 (4.17.0) генерация метамодели невозможна. Вероятно, это связано с тем, что код, созданный в папке src, удаляется (Contents of generated source directory may be deleted). За рубежом также встречаются подобные проблемы, см. https://stackoverflow.com/questions/3580564/eclipse-3-5-annotation-processor-generated-classes-cannot-be-imported.