Эта строка:
"%CD%"\runtime\pgsql\bin\pg_ctl -D "%CD%"\runtime\pgsql\data -l
рекомендуется заменить на:
"%CD%"\runtime\pgsql\bin\pg_ctl.exe stop -D "%CD%"\runtime\pgsql\data -l

В моей текущей тестовой среде, win7 Enterprise Edition, если не внести изменения, программное обеспечение не сможет быть повторно запущено после перезагрузки. База данных выдаст ошибку и не запустится.