1 В избранное 0 Ответвления 0

OSCHINA-MIRROR/langhuihui-Imprint-genetics

Присоединиться к Gitlife
Откройте для себя и примите участие в публичных проектах с открытым исходным кодом с участием более 10 миллионов разработчиков. Приватные репозитории также полностью бесплатны :)
Присоединиться бесплатно
В этом репозитории не указан файл с открытой лицензией (LICENSE). При использовании обратитесь к конкретному описанию проекта и его зависимостям в коде.
Клонировать/Скачать
Внести вклад в разработку кода
Синхронизировать код
Отмена
Подсказка: Поскольку Git не поддерживает пустые директории, создание директории приведёт к созданию пустого файла .keep.
Loading...
README.MD

Основы генетики

  • Программа реализует содержание генетики, описанное в книге «ГЭБ».*

  • Генетика представляет собой упрощённую версию реальной генетики.*

  • Эта теория связана с концепцией самореференции и описывает процесс копирования РНК самой себя.*

Основные понятия

  1. Базовые основания Всего существует 5 видов оснований, но программа использует только 4 из них:

A — аденин, G — гуанин, T — тимин, C — цитозин, U — урацил (в ДНК вместо T).

  1. РНК Представляет собой последовательность базовых оснований, подобно строке. Например, AAGGTTCCGA.

  2. Аминокислоты Используются для создания основных единиц белков, всего существует 15 типов: |Тип|Функция |:---:|:---:| |cut|Разрезать строку |del|Удалить основание из строки |swi|Переместить фермент на другую строку |mvr|Сдвинуть вправо на одну единицу |mvl|Сдвинуть влево на одну единицу |cop|Войти в режим копирования |off|Выйти из режима копирования |ina|Вставить A справа от текущего положения |inc|Вставить C справа от текущего положения |ing|Вставить G справа от текущего положения |int|Вставить T справа от текущего положения |rpy|Найти ближайший пиримидин справа |rpu|Найти ближайший пурин справа |lpy|Найти ближайший пиримидин слева |lpu|Найти ближайший пурин слева

  3. Ферменты Белки, которые могут воздействовать на РНК и выполнять её команды. Ферменты состоят из аминокислот.

  4. Рибосома Может переводить последовательности РНК в ферменты.

  5. Режим копирования Строка может быть скопирована в другую строку, но правило состоит в том, что пурины копируются в пиримидины, а пиримидины в пурины, это называется комплементарным спариванием: A<==>T G<==>C Когда фермент входит в режим копирования, он создаёт дополнительную строку, которая прикрепляется к текущей строке.

Перевод

Перевод осуществляется рибосомой на основе пар оснований в строке.

A C G T
A cut del swi
C mvr mvl cop off
G ina inc ing int
T rpy rpu lpy lpu
Например, если разделить TAGATCCAGTCCACATCGA на пары, получим:
TA GA TC CA GT CC AC AT CG A
После перевода в фермент получаем:
rpy-ina-rpu-mvr-int-mvl-cut-swi-cop

Трёхмерная структура ферментов

cut: s, del: s, swi: r, mvr: s, mvl: s, cop: r, off: l, ina: s, inc: r, ing: r, int: l, rpy: r, rpu: l, lpy: l, lpu: l s обозначает прямое движение, l обозначает поворот налево, r обозначает поворот направо.

cop ↑ swi←cut←mvl←int ↑ mvr ↑ rpy → ina→ rpu

Направление первой и последней частей определяет, где фермент предпочитает закрепляться на основании.

Первая часть Последняя часть Закреплённое основание
A
C
G
T

Комментарии ( 0 )

Вы можете оставить комментарий после Вход в систему

Введение

Импорт генетики Развернуть Свернуть
Отмена

Обновления

Пока нет обновлений

Участники

все

Недавние действия

Загрузить больше
Больше нет результатов для загрузки
1
https://api.gitlife.ru/oschina-mirror/langhuihui-Imprint-genetics.git
git@api.gitlife.ru:oschina-mirror/langhuihui-Imprint-genetics.git
oschina-mirror
langhuihui-Imprint-genetics
langhuihui-Imprint-genetics
master